Naše největší vodní plochy Lipno a Nové Mlýny spadají stejně jako všechna oranžově vyznačená místa do režimu, kde je plavba se spalovacími motory povolena pouze veřejné dopravě, policii, Státní plavební správě, hasičům, záchranářům a plachetnicím s pomocným motorem. Na ostatních červeně vyznačených vodních plochách je plavba lodí se spalovacími motory zakázaná (zákazy mohou být vyznačeny plavebním znakem A 12). Při sportovních soutěžích je zde možné udělit výjimky pro pořadatele, rozhodčí či trenéry. Dále je plavba zakázána při povodních, v ochranných pásmech vodních zdrojů I. stupně a na nádržích určených pro chovryb. Tyto vodní plochy jsou na březích označeny výstražnými tabulemi.

Bez omezení (vyznačeno modře) lze s motorovým člunem jezdit vždy ve vzdálenosti větší než 25 m od břehu na Labi od říčního km 102,2 (Chvaletice) po hranici s Německem a na Vltavě od říčního km 91,5 (Třebenice) po soutok s Labem včetně ústí Berounky po přístav Radotín a od říčního km 135,0 (Kamýk) po říční km 140. V období od 15. září do 15. června ještě na Slapech od říčního km 105 (Živohošť, ústí Mastníka) po říční km 128,93 (Vestec, silniční most) a na Orlíku od říčního km 159,9 (Orlík, Žďákovský most) po říční km 193 (Rejsíkov).